Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CA9Q16790 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms