Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPPQ16740 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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