Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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