Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms