Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A3Q16572 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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