Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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