Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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