Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF2Q15853 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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