Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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