Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms