Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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