Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms