Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms