Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NCAPHQ15003 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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