Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms