Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIN2CQ14957 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms