Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFTN1Q14699 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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