Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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