Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms