Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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NCOA4Q13772 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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