Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms