Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms