Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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