Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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