Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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MRPL28Q13084 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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MRPL28Q13084 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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MRPL28Q13084 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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MRPL28Q13084 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MRPL28Q13084 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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