Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN3Q13064 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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