Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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