Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms