Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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