Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms