Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms