Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EP300Q09472 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EP300Q09472 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EP300Q09472 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms