Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms