Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms