Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms