Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms