Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMX2Q04743 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EMX2Q04743 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms