Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAP2Q03519 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms