Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU5F1Q01860 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms