Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPCQ01831 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
XPCQ01831 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
XPCQ01831 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
XPCQ01831 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
XPCQ01831 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms