Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms