Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK16Q00536 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms