Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms