Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MRE11P49959 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MRE11P49959 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MRE11P49959 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
MRE11P49959 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MRE11P49959 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms