Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IQGAP1P46940 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IQGAP1P46940 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms