Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA4P43681 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms