Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA3P43357 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms