Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MDH1P40925 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MDH1P40925 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MDH1P40925 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MDH1P40925 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MDH1P40925 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MDH1P40925 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MDH1P40925 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms