Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJC1P36383 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJC1P36383 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJC1P36383 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJC1P36383 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJC1P36383 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJC1P36383 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GJC1P36383 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GJC1P36383 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GJC1P36383 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GJC1P36383 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GJC1P36383 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GJC1P36383 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJC1P36383 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms