Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms